O relógio molecular é um conceito revolucionário em biologia evolutiva que permite datar eventos de especiação usando a taxa de acúmulo de mutações no genoma.
A expressão "relógio molecular" designa a possibilidade de estimar o tempo decorrido desde a divergência de duas linhagens, medindo a quantidade de diferenças acumuladas em suas sequências biomoleculares. O princípio baseia-se na ideia de que as substituições neutras se acumulam a um ritmo médio, ritmo que pode ser explorado como um cronômetro.
N.B.:
Uma substituição neutra é uma mudança na sequência de DNA ou proteína que não tem nenhum efeito na sobrevivência ou reprodução do organismo. Essas substituições não são favorecidas nem eliminadas pela seleção natural e, portanto, acumulam-se de forma aleatória ao longo do tempo.
Em sua forma mais simples, a relação que liga divergência e tempo é dada por \(T = \dfrac{D}{2\mu}\).
| Símbolo | Nome | Unidade | Significado físico |
|---|---|---|---|
| \(T\) | Tempo de divergência | anos (ou Ma) | Duração decorrida desde que duas linhagens divergiram de um ancestral comum; é a medida de tempo que o relógio molecular permite estimar. |
| \(D\) | Distância genética | substituições/sítio | Proporção média de diferenças acumuladas entre duas sequências homólogas desde sua separação; reflete o número de substituições neutralizadas por evolução independente em cada linhagem. |
| \(\mu\) | Taxa de mutação | substituições/sítio/ano | Frequência com que uma base particular é substituída por outra ao longo de uma unidade de tempo em uma linhagem; é a velocidade do relógio molecular. |
N.B.:
Em biologia evolutiva, uma linhagem designa um conjunto de organismos descendentes uns dos outros por reprodução, formando uma cadeia contínua no tempo. No contexto do relógio molecular, cada linhagem acumula substituições de forma independente, e a distância genética \(D\) entre duas linhagens corresponde à soma das mudanças ocorridas em cada uma desde seu último ancestral comum.
O relógio molecular revolucionou nossa compreensão da evolução, permitindo datar com precisão eventos-chave na história da vida, desde divergências entre grandes grupos taxonômicos até eventos evolutivos recentes.
Ele resolveu, em particular, debates de longa data sobre a cronologia da evolução e forneceu quadros temporais para fenômenos tão variados como o surgimento de novas espécies, migrações humanas, a origem de pandemias e a domesticação de espécies.
| Evento de divergência | Tempo estimado | Material genético utilizado | Confiabilidade |
|---|---|---|---|
| Eucariotos - Procariotos | 2-3 bilhões de anos | Genes ribossomais | Moderada |
| Origem da fotossíntese | 2,5-3,2 bilhões de anos | Genes fotossintéticos | Moderada |
| Mamíferos - Aves | 310 milhões de anos | Genes conservados | Média |
| Origem das plantas com flores | 300 milhões de anos | Genes cloroplásticos | Média |
| Radiação (diversificação rápida) dos dinossauros | 230-250 milhões de anos | Genes esqueléticos | Moderada |
| Divergência aves - crocodilianos | 240-275 milhões de anos | Genes nucleares | Média |
| Radiação (diversificação rápida) dos mamíferos placentários | 66-100 milhões de anos | DNA mitocondrial e nuclear | Média |
| Cetáceos - Hipopótamos | 50-60 milhões de anos | Genes nucleares | Alta |
| Humano - Chimpanzé | 6-8 milhões de anos | Genoma nuclear e mitocondrial | Alta |
| Camundongo - Rato | 12-24 milhões de anos | Genoma completo | Alta |
| Divergência Neandertal - Humano moderno | 550.000-765.000 anos | Genoma nuclear antigo | Alta |
| Domesticação do cão | 15.000-40.000 anos | DNA mitocondrial | Média |
| Colonização das Américas | 15.000-20.000 anos | Genoma humano completo | Alta |
| Saída da África do Homo sapiens | 60.000-100.000 anos | DNA mitocondrial e cromossomo Y | Alta |
| Domesticação do arroz | 8.000-13.000 anos | Genoma cloroplástico | Alta |
| Emergência do VIH-1 | Início do século XX | Genoma viral completo | Alta |
| Emergência do SARS-CoV-2 | 2019 | Genoma viral completo | Alta |
Fontes complementares e ferramentas: PubMed / NCBI, BEAST (relógios bayesianos), Literatura científica.
Apesar de seu poder, o relógio molecular apresenta várias limitações importantes:
Fonte: Nature - The molecular clock and evolutionary relationships e Science - Molecular Clocks in Evolution.